MaxQuant是一款先进的，免费的用于分析大型质谱数据集的定量蛋白质组学软件包，用于LC-MS/MS质谱测序数据的标量及非标量蛋白数据库搜索及分析，它是专门针对高分辨率的MS数据，支持多种定量标记技术及非标定量。